Para la Liga 2023-1, los azules disputaron un total de 28 partidos. En la primera fase, el todos contra todos, Millonarios FC ocupó la segunda posición con 38 puntas tras 20 partidos jugados donde logró 10 victorias, 8 empates y solo 2 derrotas. De esta forma, el equipo tuvo la ventaja del punto invisible.
En la fase de cuadrangulares finales, el equipo hizo parte del grupo B que compartió con América de Cali, Boyacá Chicó e Independiente Medellín. Durante las seis fechas en esta fase, el equipo permaneció en el primer lugar. De esta manera, Millonarios se clasificó a la final con 13 puntos tras 4 victorias, 1 empate y una derrota.
Para la gran final, que definía al campeón de la Liga en el primer semestre, el partido de ida se disputó en Medellín donde el marcador final fue empate sin goles. En la vuelta, Atlético Nacional abrió el marcador pero un gol de Llinás empató la serie de nuevo y el título se definió desde la tanda de penales. Larry fue el encargado de cobrar el penal que definiría al vencedor. Tras anotar el gol, Millonarios FC venció a Atlético Nacional 3 – 2 en penales y consiguió su estrella décimo sexta en la historia.
Para el segundo semestre, en el todos contra todos, el equipo finalizó séptimo con 30 puntos luego de 8 victorias, 6 empates y 6 derrotas. Para la fase de cuadrangulares finales, el equipo se enfrentó en el ‘grupo de la muerte’ contra América, Independiente Medellín y Atlético Nacional. Con 9 unidades, al equipo no le alcanzó para llegar a la final. Ocupó el segundo puesto en el grupo.
Simultáneamente al segundo semestre de la Liga, el equipo disputó la Copa 2023 donde llegó a la final que jugó contra Atlético Nacional. En total, el equipo ganó 4 partidos y empato otros 4 en este certamen.
En la CONMEBOL Libertadores, el equipo llegó hasta la tercera fase, donde se enfrentó a Atlético Mineiro. A pesar de que el equipo fue derrotado 4-2 en el marcador global, obtuvo un cupo para disputar la fase de grupos de la CONMEBOL Sudamericana. Allí el equipo se enfrentó a Peñarol de Uruguay, América de Brasil y Defensa y Justicia de Argentina.
